反硝化滤池根据水力流态分为上流式和下流式两种形态。上流式的反硝化滤池形态和传统的生物滤池的结构较为类似,污水从下部往上部流动,滤池从下往上分为配水层、承托层、填料层、清水层。下流式的反硝化滤池形态和V型滤池结构较为类似,污水从滤池上部配水槽进入滤料区,滤池从上往下分为配水区、填料区、承托层、出水收集区。
与曝气生物滤池相比,反硝化滤池无需在滤池中增加曝气设备,仅设计用于气洗联合冲洗的反冲设备。为了确保反硝化滤池的正常运行,常常配备有气水联合反冲洗设备。
滤池承托层一般由滤板、滤头、承托层滤料组成,反冲洗系统(冲洗水管、冲洗气管)也在承托层的滤板下布置新型的滤池主要将滤头优化为方便布水布气的新型滤砖,优化了气水分配。
滤料也从普通的鹅卵石、砾石等转变为陶粒、无烟煤、火山石以及高分子惰性载体这类比表面积大,截污能力强的载体材料。上流滤池冲洗方向和进水水流方向是同向的,因此在滤池的出水区常常会有一个冲洗废水收集池/槽,冲洗完的废水回流至进水配水区。